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大數(shù)據(jù)發(fā)力,新發(fā)地疫情源頭指向冷鏈?zhǔn)称?,還從2000多個(gè)攤位鎖定攤主

2020/10/28
導(dǎo)讀
這是目前研究者提供的、最有可能的科學(xué)解釋。

北京新發(fā)地農(nóng)貿(mào)市場(chǎng),圖片來(lái)自xinfadi.com.cn
 

整理 | 湯佩蘭、葉水送


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有關(guān)新冠病毒的起源,我們可能很難追蹤,但北京新發(fā)地市場(chǎng)的疫情源頭有了最新的科學(xué)解釋。到底科學(xué)家是怎么說(shuō)的,他們?cè)谒菰吹倪^(guò)程中是如何抽絲剝繭,發(fā)現(xiàn)線索的?

 

新發(fā)地新冠疫情雖然早已被控制住,但這場(chǎng)疫情留下的緊張氣氛仍令人心有余悸,疫情的源頭也一直成謎。

 

10月23日,來(lái)自清華大學(xué)、北京市疾病預(yù)防控制中心、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所、北京大學(xué)等單位的科學(xué)家在連續(xù)攻關(guān)4個(gè)月后,終于給出了結(jié)論:通過(guò)對(duì)2020年6月北京疫情相關(guān)病例、環(huán)境與食品等樣品的核酸測(cè)序和病毒基因組序列分析,結(jié)合全面的流行病學(xué)調(diào)查和大數(shù)據(jù)分析,揭示了該疫情可能源于冷鏈?zhǔn)称肺廴?,提出冷鏈運(yùn)輸可能是新冠病毒傳播的新途徑。相關(guān)研究發(fā)表在國(guó)內(nèi)頂尖學(xué)術(shù)期刊《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》(NSR)上。

 

為何科學(xué)家將疫情源頭追溯到被污染的冷鏈?zhǔn)称???shí)際上,一開(kāi)始連從事這項(xiàng)研究的科學(xué)家都不太敢相信這一結(jié)論。


論文的作者之一、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所研究員任麗麗在接受《賽先生》訪談時(shí)表示,在整個(gè)病毒的傳播歷程和傳染病的防控史上,貨物通過(guò)冷鏈傳播到人身上造成的感染很少見(jiàn),因此這也被很多專(zhuān)家認(rèn)為是最不可能的一條線,但證據(jù)的矛頭恰恰指向了這里。

 

為何將此輪疫情源頭鎖定在新發(fā)地


科學(xué)家是如何堅(jiān)持這一看法,并令自己和公眾信服的呢?具體情況是這樣的,從6月11日起,北京市豐臺(tái)區(qū)連續(xù)出現(xiàn)本土傳播確診病例且均有新發(fā)地農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)市場(chǎng)活動(dòng)史。

 

通過(guò)對(duì)病例的流行病學(xué)調(diào)查和大數(shù)據(jù)分析,以及通過(guò)對(duì)他們所到地區(qū)和接觸人員的排查,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)2份來(lái)自北京新發(fā)地市場(chǎng)的環(huán)境樣本呈現(xiàn)新冠病毒核酸陽(yáng)性。隨后對(duì)該市場(chǎng)538名員工擴(kuò)大進(jìn)行病毒核酸篩查,又發(fā)現(xiàn)45人為陽(yáng)性。

 

新發(fā)地市場(chǎng)病毒的源頭初步查明,圖源中國(guó)青年報(bào)
 

6月15日,北京市啟動(dòng)了全市核酸篩查。通過(guò)對(duì)1000余萬(wàn)人口和5000余份環(huán)境樣本的檢測(cè),共發(fā)現(xiàn)368人新冠病毒核酸陽(yáng)性。這些感染者均與新發(fā)地市場(chǎng)有直接或者間接關(guān)聯(lián):其中169人是新發(fā)地市場(chǎng)的工作人員,103人于5月30日至6月12日期間去過(guò)新發(fā)地市場(chǎng),其余96人均為上述人員的接觸者。

 

研究發(fā)現(xiàn),未發(fā)現(xiàn)獨(dú)立于該市場(chǎng)的早期傳播鏈或獨(dú)立傳播鏈,這提示新發(fā)地市場(chǎng)是此次疫情暴發(fā)的單一源頭。

 

從一個(gè)大農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)鎖定到具體的攤位


然而,科學(xué)家并不滿(mǎn)足這一結(jié)論,他們希望能夠精準(zhǔn)到新發(fā)地市場(chǎng)具體的攤位及其對(duì)應(yīng)的攤主,以此了解新冠病毒是如何從一個(gè)點(diǎn)傳播至一個(gè)面,乃至北京市的數(shù)個(gè)片區(qū)。

 

通過(guò)對(duì)5月20日到5月30日到過(guò)新發(fā)地14個(gè)攤位的3000多人進(jìn)行抗體檢測(cè)等大數(shù)據(jù)分析,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)有5例為IgG/IgM抗體陽(yáng)性,這顯示他們?cè)腥具^(guò)新冠病毒。根據(jù)新發(fā)地網(wǎng)站介紹,新發(fā)地有2000多個(gè)固定攤位,大約有4000個(gè)定點(diǎn)商家。那么,此次疫情是單個(gè)源頭,還是多個(gè)源頭?

 

新發(fā)地綜合交易大廳負(fù)一層(牛羊肉廳)感染工作人員分布
 

通過(guò)流調(diào)手段發(fā)現(xiàn),這5例感染者于5月30日到31日期間到過(guò)S14號(hào)攤位。由此,科學(xué)家根據(jù)新發(fā)地市場(chǎng)流行病學(xué)調(diào)查,初步確定了綜合交易大廳地下一層(牛羊肉大廳)水產(chǎn)區(qū)S14號(hào)攤位可能是感染的源頭。


事實(shí)上,S14號(hào)攤位的7位工作人員均為新冠確診病例,且癥狀出現(xiàn)時(shí)間相對(duì)較早,除此之外,在S14號(hào)攤位也檢測(cè)到了陽(yáng)性的環(huán)境樣本。由此基本上鎖定了此次病毒傳播的具體攤位。


S14號(hào)攤主是如何感染新冠病毒的?

 

那么,S14號(hào)攤位的工作人員是如何接觸到新冠病毒、這些病毒來(lái)自何處?據(jù)研究者調(diào)查知悉,5月30日,S14號(hào)的攤主從X公司采購(gòu)了受新冠病毒影響的國(guó)家包裝完整的三文魚(yú),并在市場(chǎng)內(nèi)切割處理后零售。

 

在展開(kāi)流調(diào)過(guò)程中,科學(xué)家確認(rèn)了S14號(hào)攤位的工作人員此前未接觸過(guò)疑似或確診新冠病毒感染者,且5月至6月初期北京也無(wú)報(bào)告新增感染病例,這提示新冠病毒極可能來(lái)源于境外輸入,即可能通過(guò)被新冠病毒污染的冷凍食品流入國(guó)內(nèi)。

 

在大數(shù)據(jù)分析一展身手后,接下來(lái)就該讓分子生物學(xué)施展拳腳了。科學(xué)家通過(guò)對(duì)110個(gè)病例和環(huán)境樣本進(jìn)行了高通量核酸測(cè)序,共獲得了72條高質(zhì)量的新冠病毒基因組序列。分析發(fā)現(xiàn),這些序列均具有8個(gè)特征性突變位點(diǎn)(C241T、C3037T、C14408T、A23403G、GGG28881-28883AAC和C6026T),這些位點(diǎn)在我國(guó)此前的本土和輸入病例中從未發(fā)現(xiàn)過(guò)。通過(guò)與新冠病毒基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),發(fā)現(xiàn)除C6026T之外,具有其它7個(gè)突變位點(diǎn)的病毒主要存在于歐洲。這些結(jié)果進(jìn)一步提示新發(fā)地疫情的病毒應(yīng)為單一性的新發(fā)境外輸入。

 

據(jù)了解,此前接觸S14攤位之后被感染的5位顧客及其密切接觸者在過(guò)去14天內(nèi)均未到訪過(guò)中高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域或接觸來(lái)自中高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域的人員,這說(shuō)明此輪新冠疫情是由新發(fā)地市場(chǎng)向外傳播。

 

科學(xué)家還對(duì)新發(fā)地市場(chǎng)內(nèi)所有三文魚(yú)供應(yīng)商的冷庫(kù)進(jìn)行了采樣檢測(cè),發(fā)現(xiàn)X公司有5份魚(yú)體拭子樣本呈新冠病毒核酸陽(yáng)性,其中1份未開(kāi)封魚(yú)體拭子樣本中測(cè)序獲得的病毒基因組序列與本次疫情中人和環(huán)境樣本中的病毒高度同源。

 

實(shí)際上,病毒在冷凍的情況下,可以存活很長(zhǎng)時(shí)間,新冠病毒也不例外。一名流行病學(xué)家曾對(duì)《賽先生》表示,有些病毒在冷凍狀態(tài)下可以長(zhǎng)期存活。如果是水源污染水產(chǎn)品,還可能會(huì)導(dǎo)致人群發(fā)病,過(guò)去多見(jiàn)于甲肝病毒暴發(fā)。 


為何懷疑被污染的食品,而不是活的水生動(dòng)物?

 

事實(shí)上,此前調(diào)查人員就已經(jīng)懷疑疫情可能來(lái)自進(jìn)口的三文魚(yú),只是無(wú)法拿出科學(xué)的依據(jù)。6月12日,北京新發(fā)地批發(fā)市場(chǎng)董事長(zhǎng)張玉璽曾表示相關(guān)部門(mén)抽檢時(shí),在切割進(jìn)口三文魚(yú)的案板中檢測(cè)到新冠病毒。

 

10月17日,中國(guó)疾病預(yù)防控制中心發(fā)文稱(chēng),在對(duì)青島新冠肺炎疫情溯源調(diào)查過(guò)程中,從進(jìn)口冷鏈?zhǔn)称吠獍b檢測(cè)分離到新冠活病毒,也是國(guó)際上首次在冷鏈?zhǔn)称吠獍b上分離到新冠活病毒,并證實(shí)接觸新冠活病毒感染的外包裝可導(dǎo)致感染。

 

新冠病毒是否有可能來(lái)自活的水生生物?根據(jù)世界衛(wèi)生組織等權(quán)威機(jī)構(gòu)認(rèn)定,目前在我們認(rèn)知的范圍內(nèi)冠狀病毒是不能感染水生生物的,但在它們的體表可能會(huì)攜帶有病毒,只是在這種情況下感染人則非常罕見(jiàn)。

 

如此一來(lái),我們看似找到了完美的證據(jù)鏈:從切割的魚(yú)體上分離出病毒,它們跟患者身上的序列類(lèi)似,再結(jié)合流行病學(xué)的證據(jù),然而由此獲得的結(jié)論仍是具有極大概率的推測(cè)。而且當(dāng)時(shí)的情況是,由于新冠肺炎有潛伏期,同一批次的產(chǎn)品已經(jīng)沒(méi)有了,只能從相同貨源而來(lái)、間隔時(shí)間較短的第二批次中尋找答案,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了同一突變特征的序列,以此進(jìn)行佐證。

 

“這提醒我們盡可能以證據(jù)為主,證據(jù)告訴我們什么(就是什么),就主動(dòng)地追查證據(jù),不要主觀的把鏈條給斷掉了?!比嘻慃惐硎?。

 

在科學(xué)家公布新發(fā)地疫情的可能源頭并進(jìn)行一番科學(xué)分析之后。相關(guān)部門(mén)也開(kāi)始有動(dòng)作了。

 

10月26日,北京市市場(chǎng)監(jiān)督管理局聯(lián)合北京市商務(wù)局發(fā)布通告,為落實(shí)新冠肺炎疫情防控要求,進(jìn)一步加強(qiáng)對(duì)進(jìn)口冷鏈?zhǔn)称繁O(jiān)管。要求自2020年11月1日起,北京市進(jìn)口冷鏈?zhǔn)称飞a(chǎn)經(jīng)營(yíng)單位均需在“北京冷鏈”中如實(shí)上傳進(jìn)口冷藏冷凍肉類(lèi)、水產(chǎn)品來(lái)源、流向等追溯數(shù)據(jù),落實(shí)電子追溯碼賦碼、貼碼等。對(duì)未上傳追溯數(shù)據(jù)的相關(guān)產(chǎn)品,北京市進(jìn)口冷鏈?zhǔn)称飞a(chǎn)經(jīng)營(yíng)單位應(yīng)做到不采購(gòu)、不銷(xiāo)售、不使用。

 
參考資料
1.科研成果|王建斌課題組合作解析新發(fā)地疫情病毒傳播途徑.
2.專(zhuān)家釋疑北京疫情:三文魚(yú)能感染新冠病毒嗎?
3.中國(guó)疾病預(yù)防控制中心在冷鏈?zhǔn)称吠獍b分離到新冠活病毒http://www.chinacdc.cn/yw_9324/202010/t20201017_222144.html
4.北京市推廣應(yīng)用進(jìn)口冷鏈?zhǔn)称纷匪萜脚_(tái)
http://scjgj.beijing.gov.cn/zwxx/scjgdt/202010/t20201026_2120688.html
 

制版編輯 | 常春藤


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