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好奇者的最佳獎賞:得到諾獎還是發(fā)現(xiàn)的那一刻?

2024/10/17
導(dǎo)讀
“獲獎工作揭示了一個全新的生理機制,沒有人預(yù)料到,完全是出乎意料的。這表明好奇心驅(qū)動的研究非常重要?!? —— 諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會副主席Olle K?mpe
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2024年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎獲得者:Victor Ambros(左)和Gary Ruvkun(右)

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導(dǎo)讀:

     “獲獎工作揭示了一個全新的生理機制,沒有人預(yù)料到,完全是出乎意料的。這表明好奇心驅(qū)動的研究非常重要。 

—— 諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會副主席Olle K?mpe

陳曉雪 王茜 | 撰文

今年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎由兩位遺傳學(xué)家獲得,一位是來自麻省大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Victor Ambros教授,一位是來自哈佛醫(yī)學(xué)院及麻省總醫(yī)院的Gary Ruvkun教授。他們在幾十年前研究一種毫米大小的秀麗隱桿線蟲時,發(fā)現(xiàn)了一類叫做微小RNA的分子,對包括人類在內(nèi)的多細(xì)胞生物的發(fā)育和健康至關(guān)重要。
微小RNA的英文簡稱為micro-RNA或miRNA,非常短小,長度通常只有20-25個核苷酸,但在細(xì)胞基因表達和調(diào)控方面發(fā)揮了重要的作用。
“獲獎工作揭示了一個全新的生理機制,沒有人預(yù)料到,完全是出乎意料的。這表明好奇心驅(qū)動的研究非常重要?!敝Z貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會副主席Olle K?mpe教授在當(dāng)天的新聞發(fā)布會上表示。
HHMI Janelia Farm的資深研究員王萌表示,對于諾貝爾獎頒發(fā)給miRNA非常高興,“不止是因為自己導(dǎo)師(Gary Ruvkun)拿獎,也是因為基礎(chǔ)研究被肯定,miRNA在各個物種中都是非常重要的調(diào)節(jié)機制,從科學(xué)發(fā)現(xiàn)的角度非常重要”。
在Victor Ambros和 Gary Ruvkun的帶動下,miRNA在2000年之后迎來十多年的黃金發(fā)展期。但也有miRNA領(lǐng)域的研究者提醒,miRNA領(lǐng)域的研究,由于研究思路單一,甚至逐漸套路,相關(guān)研究轉(zhuǎn)冷,近年來一度成為生物醫(yī)學(xué)類論文造假重災(zāi)區(qū)。
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1. 源自好奇的發(fā)現(xiàn)


miRNA研究最初的發(fā)現(xiàn),源自兩位獲獎人對于秀麗隱桿線蟲發(fā)育的研究。

Ambros1953年出生在美國新罕布什爾州的漢諾威,1975年從畢業(yè)麻省理工學(xué)院后跟隨David Baltimore研究脊髓灰質(zhì)炎病毒基因組結(jié)構(gòu)和復(fù)制,1979年從麻省理工學(xué)院獲得博士學(xué)位,當(dāng)年加入Robert Horvitz實驗室做博士后研究。

Ruvkun比Ambros大一歲,其后加入Robert Horvitz實驗室做博士后研究,卻晚了三年。這是因為他的學(xué)術(shù)之路并非線性,而是在大學(xué)畢業(yè)后有了一個分叉。Ruvkun21歲從加州大學(xué)伯克利分校畢業(yè),先是在加州旅行了一番,后花了一年在俄勒岡的山區(qū)種樹,接著走遍了南美洲。但是,一本科普雜志,讓他幡然醒悟,決定回到學(xué)術(shù)界。在加州伯克利擔(dān)任了一年技術(shù)員之后,他于1976年進入哈佛讀博,并在1982年獲得博士學(xué)位,隨后在 Horvitz實驗室認(rèn)識了Ambros。

當(dāng)時的研究已經(jīng)知道,秀麗隱桿線蟲的壽命雖然短,只有兩三周的時間,但是它的發(fā)育過程是高度時序性的,即每個發(fā)育階段都有精確的時間表,某些基因在特定時間點必須關(guān)閉或開啟才能確保正常發(fā)育,而且有些突變會導(dǎo)致小蟲子們出現(xiàn)顯著的發(fā)育缺陷。

在 Horvitz 實驗室期間,兩個年輕人研究了秀麗隱桿線蟲的兩種基因突變體 lin-4 和 lin-14。對這兩個基因關(guān)系的研究,將二人引向了更為驚人的發(fā)現(xiàn)。

其中,lin-4 的基因突變體出現(xiàn)成蟲保留著幼蟲的皮膚,并且未能在正常階段停止蛻皮,重復(fù)出現(xiàn)幼蟲期,出現(xiàn)幼嫩的皮膚;而lin-14的基因突變體,由Horvitz 實驗室的研究生Edwin (Chip) Ferguson發(fā)現(xiàn),當(dāng)時他在培養(yǎng)lin-4突變體用于遺傳實驗時,發(fā)現(xiàn)有一個突變體的形態(tài)幾乎正常,并能正常產(chǎn)卵。

因此,Ambros鑒定了lin-14的顯性等位基因,并發(fā)現(xiàn)這些等位基因在發(fā)育時間上存在與lin-4相反的缺陷——突變lin-14的幼年線蟲,會長出皺皺的皮膚。后來,在Ruvkun加入之后,二人一起克隆了lin-14基因。

但是,lin-14與lin-4兩個突變體表型之間的對應(yīng)關(guān)系,深深地勾起了Ambros的好奇。當(dāng)分別開展獨立研究,Ambros在他新建立的哈佛大學(xué)實驗室中分析了lin-4基因的突變體。他成功克隆了該基因,剛開始以為lin-4是表達一種調(diào)控蛋白,但后來發(fā)現(xiàn),這個基因非常小,而且這個基因的產(chǎn)物不是蛋白質(zhì),而是一個只有21個堿基的RNA分子。1993年,Ambros在Cell雜志發(fā)表了他們的成果。

而在哈佛醫(yī)學(xué)院建立的實驗室的Ruvkun,則發(fā)現(xiàn)了為何lin-14會受到非蛋白編碼的lin-4的調(diào)控。這一工作,與Ambros的工作背靠背發(fā)表在同期的Cell雜志。兩篇文章,提出了一個全新的思想:非編碼基因調(diào)控蛋白編碼基因,影響基因表達。

但是,這一開創(chuàng)性的工作,并沒有得到足夠重視。按照諾貝爾委員會的說法,科學(xué)界對此的反應(yīng)是:“震耳欲聾的沉默”。

直到2000年,Ruvkun的實驗室發(fā)現(xiàn)第二個miRNA,即let-7,顯示其能阻止靶基因的表達,改變線蟲幼蟲發(fā)育的時序。而且,Ruvkun發(fā)現(xiàn),let-7基因與lin-4不同,從果蠅到人類的一系列生物中都存在,除了植物和單細(xì)胞生物。這說明,這一分子的作用足夠保守,以至于在數(shù)百萬年的進化過程中一直保存下來。

這篇文章成為整個miRNA研究的轉(zhuǎn)折點。短短一年之后,Ambros和另外兩個研究團隊同時在Science雜志發(fā)表文章,獨立報告了從線蟲、果蠅和人類細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的近100種miRNA。這三篇文章的發(fā)表,掀起了miRNA研究領(lǐng)域的熱潮。而且,在這三篇文章中,miRNA的命名規(guī)則統(tǒng)一確定了下來。

如今,人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了 1,000 多個人類 miRNA 基因。這些基因在正常和異常發(fā)育以及心臟病、癌癥、神經(jīng)退行性疾病和其他疾病中發(fā)揮作用。

回顧第一個miRNA的發(fā)現(xiàn)歷程時,Ambros強調(diào),lin-4的發(fā)現(xiàn)持久的好奇心、運氣、時機和同事慷慨奉獻的結(jié)果。

他說,在1993年,除了少數(shù)幾個朋友外,沒有人對lin-4或它的小RNA產(chǎn)物感興趣,競爭幾乎不存在,這使得他們有時間真正對lin-4的故事進行徹底研究。

“我們覺得像lin-4這樣奇怪的基因需要格外仔細(xì)的實驗證明,而我們最自豪的正是這種細(xì)致和準(zhǔn)確。我們有足夠的自由花了將近四年的時間來完成這個項目,這在今天是不可想象的?!?004年1月,Ambros與他實驗室的兩位合作伙伴Rosalind Lee和 Rhonda Feinbaum在Cell雜志的評論文章中寫道。

而在接到諾貝爾委員會電話時,Gary Ruvkun表示,他們在發(fā)現(xiàn)第一個miRNA分子時,從沒想過有一天可以獲得諾獎?!拔覀冋谘芯恳粋€奇怪的東西,這真有趣,我們只是年輕的教員,希望我們在職業(yè)生涯的下一個階段取得成功。所以,我們并沒有想到會獲得諾貝爾獎,我們只是覺得這真的很有趣?!?/span>

Victor Ambros也表示,諾貝爾獎獎勵給線蟲研究,他感受到了一種無聲的喜悅,因為這不僅僅是特定科學(xué)家的慶祝,更是慶祝這種好奇心驅(qū)動、研究復(fù)雜遺傳學(xué)現(xiàn)象的科研方式。“你希望更多地理解這種現(xiàn)象是如何運作的,當(dāng)發(fā)現(xiàn)足夠新而且引發(fā)廣泛的興趣時,總是令人驚奇?!?/span>

王萌曾在Gary Ruvkun的實驗做過5年的博士后研究,現(xiàn)在研究代謝和衰老的相互作用。她補充說,“Gary,Victor,包括我自己都是做遺傳的,從老祖宗孟德爾、摩爾根開始,做研究純粹是因為好奇心,想了解Why。這些年在各種因素的影響下,這樣的科學(xué)家可能越來越少了,所以我覺得介紹他們,獎勵他們,是一件很有意義的事情。

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2. 研究者的獎賞時刻

盡管miRNA的工作重要,但Victor Ambros和Gary Ruvkun這兩位最關(guān)鍵的發(fā)現(xiàn)者曾一度被認(rèn)為與諾貝爾獎擦肩而過。這主要是因為2006年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎獎勵的RNAi的工作,與miRNA調(diào)控基因的機制有些相通。
因此,當(dāng) Ambros得知自己獲獎時,非常意外?!半m然有人會時不時提到你可能會拿諾貝爾獎,但我不會當(dāng)真,不不,RNAi的獎項已經(jīng)覆蓋了miRNA的工作?!?/span>
2006年,正是王萌在Ruvkun實驗室工作的第二年。她和實驗室的小伙伴知道新的諾獎得主 Andrew Z. Fire和Craig C. Mello都是領(lǐng)域內(nèi)非常知名的科學(xué)家,也為他們高興,但依然覺得有些惋惜。王萌回憶說,“Ruvkun云淡風(fēng)輕地說了一句,‘這個事情不是那么重要,我們做science不是為了諾獎。發(fā)現(xiàn)微小RNA機制的時候,那個是最rewarding的時刻?!?/span>
“我覺得可能他并沒有很在意這件事情,但是我覺得他拿到(諾獎)肯定還是非常開心的?!蓖趺日f。
在與知識分子與抖音合作的諾貝爾獎工作解讀直播進行連線時,王萌說,她從Gary Ruvkun身上學(xué)習(xí)到的最重要的一點,是對探索未知問題的熱情和執(zhí)著。 
她說,有一段時間Ruvkun對可能的硫修飾發(fā)生了非常濃厚的興趣,但是實驗室沒有人對這個方向感興趣,Ruvkun就親自到實驗室,找她和其他博后借試劑,檢測他自己想做的方向。
雖然這個方向最后沒有成為一個非常成熟的方向,但在這段時間,她看到Ruvkun因為一個簡單的研究興趣回到實驗室,自己設(shè)計實驗、做實驗,即使在沒有人愿意和他一起做時,也愿意自己去做。“這對我觸動是非常大的,我覺得可能也影響了我之后很多想自己的科研問題時候,我應(yīng)該怎么做,我會以一個什么樣的態(tài)度來面臨更未知的一些問題。”王萌說。
“Gary非常有創(chuàng)造力,而且很嚴(yán)謹(jǐn)?!?span style=";padding: 0px;outline: 0px;max-width: 100%;text-wrap: wrap;box-sizing: border-box !important;overflow-wrap: break-word !important">斯坦福大學(xué)的遺傳學(xué)家Aaron Gitler對《賽先生》表示。
關(guān)于Ruvkun,Gitler最為深刻的印象是,他對招聘過程是非常認(rèn)真,以確保候選人合適且高度獨立。
Gitler說,當(dāng)時他的一名學(xué)生想加入Ruvkun的實驗室。他說:“他給我打電話,和我聊了超過兩個小時,討論她和她的論文,一張圖一張圖地過論文。這很不尋常。通常人們只是打個電話聊五到十分鐘,以確保沒什么問題。
他說,在Ruvkun的實驗室中,受訓(xùn)者“在與實驗室研究廣泛相關(guān)的項目上工作,但他們是獨立進行的,且開拓新的方向?!?/span>
他認(rèn)為,這種獨立性和Ruvkun創(chuàng)造的環(huán)境正是他許多學(xué)員能夠在研究中出色表現(xiàn)的原因,例如王萌,現(xiàn)在是Janelia Farm的資深研究員,正在研究衰老的分子機制,以及劉穎,現(xiàn)任北京大學(xué)教授的,則在從事細(xì)胞應(yīng)激和穩(wěn)態(tài)調(diào)控的研究。兩者都在Gary Ruvkun實驗室做過博士后研究,獨立后均開辟了自己的道路。
“一些實驗室負(fù)責(zé)人控制一切,基本上只聘請技術(shù)人員,但在我看來,最優(yōu)秀的領(lǐng)導(dǎo)者是那些有信心和安全感,能夠聘請強大、聰明、獨立的人,并讓他們茁壯成長的人?!?/span>
Gitler表示,Ruvkun正是這樣一種實驗室負(fù)責(zé)人,總是尋求聘請可能比他更聰明、更優(yōu)秀的人,并為他們提供一個良好的激勵環(huán)境,使他們能夠表現(xiàn)出色。
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3. miRNA走向應(yīng)用的挑戰(zhàn)

兩位獲獎人的研究,開啟了一場miRNA影響基因調(diào)控的研究熱潮,許多研究已經(jīng)驗證miRNA與許多疾病的發(fā)生密切相關(guān)。例如,微小RNA的異常調(diào)控可能導(dǎo)致癌癥,而在人類中發(fā)現(xiàn)編碼微小RNA的基因突變會導(dǎo)致先天性聽力喪失、眼部和骨骼疾病。

但是,miRNA的應(yīng)用之路,還依然崎嶇不平。

“你知道,還沒有什么非常接近實際應(yīng)用的東西”,諾貝爾委員會主席Gunilla Karlsson Hedestam在答記者問環(huán)節(jié)時說道。但她強調(diào),擁有基本的理解是開發(fā)應(yīng)用的第一步。

“盡管目前還沒有非常明確的應(yīng)用,但使用微小RNA,理解它們,知道它們的存在,了解它們的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),總是第一步,理解基本功能的重要性,這總是邁向應(yīng)用的第一步。這可能還需要一段時間,有很多試驗正在進行中,不僅針對癌癥,還針對其他疾病,心血管疾病,腎臟疾病?!?span style=";padding: 0px;outline: 0px;max-width: 100%;text-wrap: wrap;box-sizing: border-box !important;overflow-wrap: break-word !important">Hedestam說。

諾貝爾委員會副主席Olle K?mpe教授認(rèn)為,miRNA要用于臨床,還存在許多問題,其中有兩大挑戰(zhàn),一個是如何將miRNA遞送到正確的組織,另一個是miRNA可以結(jié)合多個目標(biāo),因此很容易產(chǎn)生脫靶效應(yīng)。

例如,“腫瘤經(jīng)常擾亂miRNA網(wǎng)絡(luò),它們可以通過刪除基因、突變處理miRNA的過程,或增加與miRNA結(jié)合的RNA結(jié)合蛋白的產(chǎn)量來實現(xiàn)這一點。有一些初步的研究正在探索是否可以通過調(diào)節(jié)RNA結(jié)合蛋白來解決這些問題,但是直接將miRNA遞送到細(xì)胞并期望只產(chǎn)生單一效果是非常困難的。

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4. 諾獎會促進miRNA研究嗎?

意料之中,因為從理論意義來說,兩位科學(xué)家的發(fā)現(xiàn)非常重要。”對于miRNA獲得此次諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎,復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院PI、研究員于文強評論道。

他也提醒說,目前miRNA的研究,在經(jīng)歷了十多年的黃金周期后,正在逐漸遇冷。

于文強長期研究細(xì)胞核內(nèi)miRNA功能及其在通過增強子介導(dǎo)的基因激活作用,曾和同事提出,細(xì)胞核內(nèi)的miRNA可以通過激活增強子(enhancer)進而發(fā)揮系統(tǒng)性的基因激活作用,細(xì)胞核內(nèi)miRNA激活基因表達具有更加普遍性的意義,可能是miRNA最主要的功能,只不過在miRNA抑制理論框架下,被大多數(shù)人視而不見罷了。

他介紹,從2000年到2011年,是miRNA研究的黃金期。期間,Science、Nature上集中發(fā)表了一些文章,介紹了很多腫瘤的發(fā)病過程與miRNA有很大關(guān)系。還有很多研究介紹了生殖發(fā)育與miRNA的關(guān)系。

”總之,你能想象到的,miRNA在生命中的各個過程(發(fā)育、造血、疾病等)呈現(xiàn)差異表達,發(fā)揮關(guān)鍵調(diào)控作用?!?/span>

但是,后來由于研究思路單一,甚至研究逐漸套路式,miRNA相關(guān)研究轉(zhuǎn)冷,甚至成為生物醫(yī)學(xué)類論文造假重災(zāi)區(qū)。

究其原因,于文強認(rèn)為,一個是人們認(rèn)為miRNA是“微調(diào)”,功能不明顯,在基因調(diào)控中沒有發(fā)揮很大的作用,被人們認(rèn)為是可有可無的角色。

而且,大部分研究都聚焦在負(fù)向調(diào)控的作用機制,千篇一律地尋找對應(yīng)的靶基因。久而久之,成為一種套路式的研究。“2011年,你能憑著miRNA申請自然基金,現(xiàn)在,你要說研究這個,基本拿不到基金?!?/span>

另外一個原因,正如諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會的兩位評委所說,當(dāng)前基于miRNA還沒有具體的應(yīng)用。例如,一款有效的藥物。

于文強介紹,早年丹麥一家制藥公司研發(fā)了一款抗丙型肝炎病毒藥物,希望通過抑制miR-122的活性,治療丙肝——因為miR-122能夠促進丙肝病毒的復(fù)制,所以通過抑制miR-122來治療丙肝病毒感染。這是首個進入臨床試驗的miRNA類藥物,成功通過了 I 期臨床和 II 期臨床。但2012年的一項研究顯示,如果把miRNA-122敲除,小鼠在11個月的時候,89%的雄性小鼠會得肝癌。這提示在抑制miR-122治療丙肝病毒感染可能誘發(fā)肝癌,顯示了miRNA調(diào)控基因表達過程的復(fù)雜性。

他認(rèn)為,miRNA藥物研發(fā)困難,在于很多miRNA調(diào)控的現(xiàn)象和機制,還有許多地方?jīng)]有完全清晰?!芭e個例子,miRNA的抑制理論只默認(rèn)它在細(xì)胞漿中發(fā)揮作用,但是miRNA在細(xì)胞核中也存在,但是它們在細(xì)胞核中如何發(fā)揮作用,用抑制理論解釋不清楚。”而在miRNA抑制理論之外,一些科學(xué)家提出一些miRNA非抑制作用的理論?!澳壳斑@樣的文章目前不超過50篇,研究機制“五花八門,跟隨者不多”。

于文強提到,NamiRNA通過增強子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)激活基因的表達,是細(xì)胞核內(nèi)miRNA發(fā)揮作用的最主要途徑,也是細(xì)胞身份轉(zhuǎn)換的主要角色,有望推動miRNA研究進入2.0時代。值得期待的是,“miRNA此次獲得諾獎,或?qū)ο嚓P(guān)研究起到促進作用?!?/span>

“像以往,每一次獲得諾獎都會引發(fā)研究熱潮,比如細(xì)胞自噬機制、PD-1,所以我相信這一次也會引發(fā)研究熱潮?!庇谖膹娬f。圖片

致謝:
感謝張?zhí)炱顚Ρ疚奶峁┲Z獎新聞發(fā)布會的中文稿。
參考文獻:下滑動可瀏覽)


1.https://profiles.umassmed.edu/display/129913

2.https://www.youtube.com/watch?v=3BBU2QI48PM&ab_channel=NobelPrize

3.https://www.youtube.com/watch?v=yAJRqvOa1UE&ab_channel=NobelPrize

4.https://www.nature.com/articles/nrm2987

5.https://news.mit.edu/2024/victor-ambros-gary-ruvkun-share-nobel-prize-physiology-medicine-1007

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7. https://www.youtube.com/watch?v=Ln5rCmDqua0&t=1s&ab_channel=NobelPrize

8. https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2024/summary/

9.https://www.umassmed.edu/contentassets/821939f44ec34a30bdb2b3f998be2ddd/pdfs/2004_shorthistory.pdf


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