好奇者的最佳獎賞:得到諾獎還是發(fā)現(xiàn)的那一刻?
2024年諾貝爾生理醫(yī)學(xué)獎獲得者:Victor Ambros(左)和Gary Ruvkun(右)
導(dǎo)讀:
“獲獎工作揭示了一個全新的生理機制,沒有人預(yù)料到,完全是出乎意料的。這表明好奇心驅(qū)動的研究非常重要。”
—— 諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會副主席Olle K?mpe
陳曉雪 王茜 | 撰文
Ambros1953年出生在美國新罕布什爾州的漢諾威,1975年從畢業(yè)麻省理工學(xué)院后跟隨David Baltimore研究脊髓灰質(zhì)炎病毒基因組結(jié)構(gòu)和復(fù)制,1979年從麻省理工學(xué)院獲得博士學(xué)位,當(dāng)年加入Robert Horvitz實驗室做博士后研究。
Ruvkun比Ambros大一歲,其后加入Robert Horvitz實驗室做博士后研究,卻晚了三年。這是因為他的學(xué)術(shù)之路并非線性,而是在大學(xué)畢業(yè)后有了一個分叉。Ruvkun21歲從加州大學(xué)伯克利分校畢業(yè),先是在加州旅行了一番,后花了一年在俄勒岡的山區(qū)種樹,接著走遍了南美洲。但是,一本科普雜志,讓他幡然醒悟,決定回到學(xué)術(shù)界。在加州伯克利擔(dān)任了一年技術(shù)員之后,他于1976年進入哈佛讀博,并在1982年獲得博士學(xué)位,隨后在 Horvitz實驗室認(rèn)識了Ambros。
當(dāng)時的研究已經(jīng)知道,秀麗隱桿線蟲的壽命雖然短,只有兩三周的時間,但是它的發(fā)育過程是高度時序性的,即每個發(fā)育階段都有精確的時間表,某些基因在特定時間點必須關(guān)閉或開啟才能確保正常發(fā)育,而且有些突變會導(dǎo)致小蟲子們出現(xiàn)顯著的發(fā)育缺陷。
在 Horvitz 實驗室期間,兩個年輕人研究了秀麗隱桿線蟲的兩種基因突變體 lin-4 和 lin-14。對這兩個基因關(guān)系的研究,將二人引向了更為驚人的發(fā)現(xiàn)。
其中,lin-4 的基因突變體出現(xiàn)成蟲保留著幼蟲的皮膚,并且未能在正常階段停止蛻皮,重復(fù)出現(xiàn)幼蟲期,出現(xiàn)幼嫩的皮膚;而lin-14的基因突變體,由Horvitz 實驗室的研究生Edwin (Chip) Ferguson發(fā)現(xiàn),當(dāng)時他在培養(yǎng)lin-4突變體用于遺傳實驗時,發(fā)現(xiàn)有一個突變體的形態(tài)幾乎正常,并能正常產(chǎn)卵。
因此,Ambros鑒定了lin-14的顯性等位基因,并發(fā)現(xiàn)這些等位基因在發(fā)育時間上存在與lin-4相反的缺陷——突變lin-14的幼年線蟲,會長出皺皺的皮膚。后來,在Ruvkun加入之后,二人一起克隆了lin-14基因。
但是,lin-14與lin-4兩個突變體表型之間的對應(yīng)關(guān)系,深深地勾起了Ambros的好奇。當(dāng)分別開展獨立研究,Ambros在他新建立的哈佛大學(xué)實驗室中分析了lin-4基因的突變體。他成功克隆了該基因,剛開始以為lin-4是表達一種調(diào)控蛋白,但后來發(fā)現(xiàn),這個基因非常小,而且這個基因的產(chǎn)物不是蛋白質(zhì),而是一個只有21個堿基的RNA分子。1993年,Ambros在Cell雜志發(fā)表了他們的成果。
而在哈佛醫(yī)學(xué)院建立的實驗室的Ruvkun,則發(fā)現(xiàn)了為何lin-14會受到非蛋白編碼的lin-4的調(diào)控。這一工作,與Ambros的工作背靠背發(fā)表在同期的Cell雜志。兩篇文章,提出了一個全新的思想:非編碼基因調(diào)控蛋白編碼基因,影響基因表達。
但是,這一開創(chuàng)性的工作,并沒有得到足夠重視。按照諾貝爾委員會的說法,科學(xué)界對此的反應(yīng)是:“震耳欲聾的沉默”。
直到2000年,Ruvkun的實驗室發(fā)現(xiàn)第二個miRNA,即let-7,顯示其能阻止靶基因的表達,改變線蟲幼蟲發(fā)育的時序。而且,Ruvkun發(fā)現(xiàn),let-7基因與lin-4不同,從果蠅到人類的一系列生物中都存在,除了植物和單細(xì)胞生物。這說明,這一分子的作用足夠保守,以至于在數(shù)百萬年的進化過程中一直保存下來。
這篇文章成為整個miRNA研究的轉(zhuǎn)折點。短短一年之后,Ambros和另外兩個研究團隊同時在Science雜志發(fā)表文章,獨立報告了從線蟲、果蠅和人類細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的近100種miRNA。這三篇文章的發(fā)表,掀起了miRNA研究領(lǐng)域的熱潮。而且,在這三篇文章中,miRNA的命名規(guī)則統(tǒng)一確定了下來。
如今,人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了 1,000 多個人類 miRNA 基因。這些基因在正常和異常發(fā)育以及心臟病、癌癥、神經(jīng)退行性疾病和其他疾病中發(fā)揮作用。
回顧第一個miRNA的發(fā)現(xiàn)歷程時,Ambros強調(diào),lin-4的發(fā)現(xiàn)持久的好奇心、運氣、時機和同事慷慨奉獻的結(jié)果。
他說,在1993年,除了少數(shù)幾個朋友外,沒有人對lin-4或它的小RNA產(chǎn)物感興趣,競爭幾乎不存在,這使得他們有時間真正對lin-4的故事進行徹底研究。
“我們覺得像lin-4這樣奇怪的基因需要格外仔細(xì)的實驗證明,而我們最自豪的正是這種細(xì)致和準(zhǔn)確。我們有足夠的自由花了將近四年的時間來完成這個項目,這在今天是不可想象的?!?004年1月,Ambros與他實驗室的兩位合作伙伴Rosalind Lee和 Rhonda Feinbaum在Cell雜志的評論文章中寫道。
而在接到諾貝爾委員會電話時,Gary Ruvkun表示,他們在發(fā)現(xiàn)第一個miRNA分子時,從沒想過有一天可以獲得諾獎?!拔覀冋谘芯恳粋€奇怪的東西,這真有趣,我們只是年輕的教員,希望我們在職業(yè)生涯的下一個階段取得成功。所以,我們并沒有想到會獲得諾貝爾獎,我們只是覺得這真的很有趣?!?/span>
Victor Ambros也表示,諾貝爾獎獎勵給線蟲研究,他感受到了一種無聲的喜悅,因為這不僅僅是特定科學(xué)家的慶祝,更是慶祝這種好奇心驅(qū)動、研究復(fù)雜遺傳學(xué)現(xiàn)象的科研方式。“你希望更多地理解這種現(xiàn)象是如何運作的,當(dāng)發(fā)現(xiàn)足夠新而且引發(fā)廣泛的興趣時,總是令人驚奇?!?/span>
王萌曾在Gary Ruvkun的實驗做過5年的博士后研究,現(xiàn)在研究代謝和衰老的相互作用。她補充說,“Gary,Victor,包括我自己都是做遺傳的,從老祖宗孟德爾、摩爾根開始,做研究純粹是因為好奇心,想了解Why。這些年在各種因素的影響下,這樣的科學(xué)家可能越來越少了,所以我覺得介紹他們,獎勵他們,是一件很有意義的事情。”
但是,miRNA的應(yīng)用之路,還依然崎嶇不平。
“你知道,還沒有什么非常接近實際應(yīng)用的東西”,諾貝爾委員會主席Gunilla Karlsson Hedestam在答記者問環(huán)節(jié)時說道。但她強調(diào),擁有基本的理解是開發(fā)應(yīng)用的第一步。
“盡管目前還沒有非常明確的應(yīng)用,但使用微小RNA,理解它們,知道它們的存在,了解它們的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),總是第一步,理解基本功能的重要性,這總是邁向應(yīng)用的第一步。這可能還需要一段時間,有很多試驗正在進行中,不僅針對癌癥,還針對其他疾病,心血管疾病,腎臟疾病?!?span style=";padding: 0px;outline: 0px;max-width: 100%;text-wrap: wrap;box-sizing: border-box !important;overflow-wrap: break-word !important">Hedestam說。
諾貝爾委員會副主席Olle K?mpe教授認(rèn)為,miRNA要用于臨床,還存在許多問題,其中有兩大挑戰(zhàn),一個是如何將miRNA遞送到正確的組織,另一個是miRNA可以結(jié)合多個目標(biāo),因此很容易產(chǎn)生脫靶效應(yīng)。
例如,“腫瘤經(jīng)常擾亂miRNA網(wǎng)絡(luò),它們可以通過刪除基因、突變處理miRNA的過程,或增加與miRNA結(jié)合的RNA結(jié)合蛋白的產(chǎn)量來實現(xiàn)這一點。有一些初步的研究正在探索是否可以通過調(diào)節(jié)RNA結(jié)合蛋白來解決這些問題,但是直接將miRNA遞送到細(xì)胞并期望只產(chǎn)生單一效果是非常困難的。”
他也提醒說,目前miRNA的研究,在經(jīng)歷了十多年的黃金周期后,正在逐漸遇冷。
于文強長期研究細(xì)胞核內(nèi)miRNA功能及其在通過增強子介導(dǎo)的基因激活作用,曾和同事提出,細(xì)胞核內(nèi)的miRNA可以通過激活增強子(enhancer)進而發(fā)揮系統(tǒng)性的基因激活作用,細(xì)胞核內(nèi)miRNA激活基因表達具有更加普遍性的意義,可能是miRNA最主要的功能,只不過在miRNA抑制理論框架下,被大多數(shù)人視而不見罷了。
他介紹,從2000年到2011年,是miRNA研究的黃金期。期間,Science、Nature上集中發(fā)表了一些文章,介紹了很多腫瘤的發(fā)病過程與miRNA有很大關(guān)系。還有很多研究介紹了生殖發(fā)育與miRNA的關(guān)系。
”總之,你能想象到的,miRNA在生命中的各個過程(發(fā)育、造血、疾病等)呈現(xiàn)差異表達,發(fā)揮關(guān)鍵調(diào)控作用?!?/span>
但是,后來由于研究思路單一,甚至研究逐漸套路式,miRNA相關(guān)研究轉(zhuǎn)冷,甚至成為生物醫(yī)學(xué)類論文造假重災(zāi)區(qū)。
究其原因,于文強認(rèn)為,一個是人們認(rèn)為miRNA是“微調(diào)”,功能不明顯,在基因調(diào)控中沒有發(fā)揮很大的作用,被人們認(rèn)為是可有可無的角色。
而且,大部分研究都聚焦在負(fù)向調(diào)控的作用機制,千篇一律地尋找對應(yīng)的靶基因。久而久之,成為一種套路式的研究。“2011年,你能憑著miRNA申請自然基金,現(xiàn)在,你要說研究這個,基本拿不到基金?!?/span>
另外一個原因,正如諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎委員會的兩位評委所說,當(dāng)前基于miRNA還沒有具體的應(yīng)用。例如,一款有效的藥物。
于文強介紹,早年丹麥一家制藥公司研發(fā)了一款抗丙型肝炎病毒藥物,希望通過抑制miR-122的活性,治療丙肝——因為miR-122能夠促進丙肝病毒的復(fù)制,所以通過抑制miR-122來治療丙肝病毒感染。這是首個進入臨床試驗的miRNA類藥物,成功通過了 I 期臨床和 II 期臨床。但2012年的一項研究顯示,如果把miRNA-122敲除,小鼠在11個月的時候,89%的雄性小鼠會得肝癌。這提示在抑制miR-122治療丙肝病毒感染可能誘發(fā)肝癌,顯示了miRNA調(diào)控基因表達過程的復(fù)雜性。
他認(rèn)為,miRNA藥物研發(fā)困難,在于很多miRNA調(diào)控的現(xiàn)象和機制,還有許多地方?jīng)]有完全清晰?!芭e個例子,miRNA的抑制理論只默認(rèn)它在細(xì)胞漿中發(fā)揮作用,但是miRNA在細(xì)胞核中也存在,但是它們在細(xì)胞核中如何發(fā)揮作用,用抑制理論解釋不清楚。”而在miRNA抑制理論之外,一些科學(xué)家提出一些miRNA非抑制作用的理論?!澳壳斑@樣的文章目前不超過50篇,研究機制“五花八門,跟隨者不多”。
于文強提到,NamiRNA通過增強子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)激活基因的表達,是細(xì)胞核內(nèi)miRNA發(fā)揮作用的最主要途徑,也是細(xì)胞身份轉(zhuǎn)換的主要角色,有望推動miRNA研究進入2.0時代。值得期待的是,“miRNA此次獲得諾獎,或?qū)ο嚓P(guān)研究起到促進作用?!?/span>
“像以往,每一次獲得諾獎都會引發(fā)研究熱潮,比如細(xì)胞自噬機制、PD-1,所以我相信這一次也會引發(fā)研究熱潮?!庇谖膹娬f。